La grande diversité génétique des groupes autochtones d’Amérique du Sud met en évidence les lacunes en matière de diversité dans la recherche en génomique

Les Amazoniens sont génétiquement aussi différents des Andins que les Européens le sont des Asiatiques de l’Est en ce qui concerne les variantes génétiques qui affectent la réponse à certains médicaments, selon un commentaire publié le 8 août dans la revue Cellule.

Ces variations génétiques peuvent avoir une incidence sur les effets secondaires ressentis par un individu et influencer les recommandations en matière de dosage des médicaments. Prenant comme exemple la diversité génétique au sein des groupes autochtones, les scientifiques soulignent la nécessité de combler le fossé en matière de diversité dans la recherche en génomique.

Historiquement, les populations amérindiennes ont été considérées comme un groupe homogène, un préjugé et une simplification excessive qui, selon les chercheurs, persistent encore aujourd’hui. Mais la réalité est bien plus complexe. Des facteurs tels que l’environnement, l’histoire et la culture ont conduit à d’importantes différences génétiques entre les populations vivant dans les Andes d’Amérique du Sud et dans les forêts amazoniennes, qui ne sont séparées que de 240 à 320 kilomètres.

« La région andine se caractérise par un environnement sec et pauvre en oxygène, à haute altitude, tandis que la région amazonienne est une forêt tropicale de basse altitude. Ces facteurs de stress environnementaux très différents peuvent entraîner des changements génétiques et des adaptations biologiques », explique l’auteur correspondant Eduardo Tarazona-Santos de l’Universidade Federal de Minas Gerais, au Brésil.

« Les Andins et les Amazoniens ont également développé des langues, des structures sociales et des pratiques agricoles distinctes, qui peuvent contribuer davantage à leur différenciation par la sélection naturelle au fil du temps. »

Les chercheurs ont analysé la diversité génomique de 294 individus issus de 17 groupes indigènes péruviens des régions andines et amazoniennes. Ils ont découvert que certaines variations génétiques font que les populations amazoniennes et andines réagissent différemment aux médicaments.

Par exemple, un pourcentage plus élevé d’Amazoniens présentent une variation qui les fait mieux répondre au traitement à la rosuvastatine, souvent prescrite pour réduire le taux de cholestérol et prévenir les événements cardiovasculaires, mais qui leur confère également des risques plus élevés d’effets secondaires.

Selon les directives cliniques, seuls 2 % des autochtones des Andes ont besoin d’une dose initiale plus faible de rosuvastatine pour prévenir les effets secondaires, contre 16 % des autochtones d’Amazonie. Ces résultats soulignent la nécessité d’intégrer la recherche en génomique pour garantir l’application efficace de la médecine de précision.

En ce qui concerne la warfarine, un médicament qui traite les caillots sanguins, le dosage est essentiel. Une dose trop faible de warfarine rend le traitement inefficace, tandis qu’une dose trop élevée peut exposer les patients à un risque de saignement important. Sur la base des variations génétiques, 69 % des populations autochtones du sud des Andes ont besoin d’une dose réduite de warfarine, contre 93 % des populations autochtones d’Amazonie.

« Ces différences génétiques affectant la pharmacologie observées chez les Andins et les Amazoniens sont encore plus importantes que celles observées entre les Européens et les Asiatiques », explique Tarazona-Santos.

Il existe certes des médicaments alternatifs à la warfarine qui ne nécessitent pas de contrôle strict de la posologie, mais ils sont dix fois plus chers et hors de portée de nombreuses personnes dans les pays en développement. Il est essentiel de comprendre les facteurs génétiques qui influencent la posologie des médicaments pour garantir l’utilisation sûre et efficace de médicaments abordables dans les pays aux ressources limitées.

S’inspirant de la diversité génétique des populations autochtones, le commentaire met en garde contre la conception des groupes ethniques comme une entité unique dans les études génomiques humaines. Il appelle également à une recherche génomique inclusive qui englobe diverses populations afin de garantir des résultats équitables en matière de soins de santé dans le monde entier.

Tarazona-Santos conclut que l’inclusion de personnes d’origines socioéconomiques et ethniques diverses dans les groupes de recherche est très importante pour les études de génomique humaine comme celle-ci. « Cela facilite la recherche et l’engagement communautaire, en offrant transparence et confiance », dit-il. « Cela permet aux gens de se sentir plus à l’aise en voyant des visages familiers de la même communauté. »