Une étude génétique de 12 ans identifie des types uniques de myélome multiple

Un effort sans précédent visant à séquencer le génome, l’exome et l’ARN dans les tumeurs de patients atteints de myélome multiple définit des sous-types distincts de la maladie, selon une équipe internationale de scientifiques dirigée par des chercheurs du Translational Genomics Research Institute (TGen), qui fait partie de la Cité de l’espoir.

Les résultats de cette étude observationnelle de 12 ans donnent une image plus claire des changements génétiques qui peuvent être importants dans chaque sous-type de ce cancer de nos cellules plasmatiques productrices d’anticorps, qui est traitable mais incurable. Ces informations pourraient aider à orienter des traitements plus personnalisés à l’avenir, écrivent les chercheurs dans Génétique de la nature.

Les scientifiques ont identifié la base génétique d’une population de patients à haut risque, appelée « PR », qui est associée à une survie médiane de moins de deux ans par rapport à la survie moyenne dans l’étude qui dépasse huit ans. Environ 25 % des patients sont passés au sous-type PR au cours de l’étude, et ceux qui sont passés au sous-type PR ont eu des résultats moins bons, avec une survie médiane de 88 jours après la transition.

« Nous connaissons ce sous-type depuis plus d’une décennie et nous avons maintenant démontré qu’il s’agit d’un groupe de patients à haut risque avec les thérapies utilisées aujourd’hui. Il est clair que ce sont des patients que nous devons inclure dans des essais cliniques car les médicaments actuels ne fonctionnent tout simplement pas pour eux », a déclaré Jonathan Keats, Ph. D., professeur adjoint, directeur du centre de bioinformatique et de séquençage collaboratif à TGen, et auteur principal de l’article.

« Ce que nous avons clairement montré, c’est qu’il existe une base génétique pour que les gens appartiennent au sous-groupe PR. »

L’étude « contribue également à souligner que la maladie à un stade avancé n’est pas comme la maladie à un stade précoce, et à une époque où nous évoluons vers une détection précoce, les médicaments qui fonctionnent au stade précoce peuvent ne pas être ceux qui fonctionnent au stade très tardif », a ajouté Keats.

L’étude CoMMpass (Relating Clinical Outcomes in Multiple Myeloma to Personal Assessment of Genetic Profile) de la Multiple Myeloma Research Foundation (MMRF) a inclus 1 143 patients issus de 84 sites cliniques situés aux États-Unis, au Canada, en Espagne et en Italie, recrutés entre 2011 et 2015 et suivis pendant au moins huit ans après le diagnostic.

Il s’agit de la plus grande étude de séquençage unique menée à ce jour sur des patients atteints de myélome multiple, en fonction du nombre de patients et du nombre d’essais de séquençage effectués.

« Il existe également des données cliniques sur ces patients collectées tous les trois mois tout au long de l’évolution de leur maladie, et pas seulement lorsqu’ils sont profilés génétiquement, ce qui constitue un véritable trésor », a déclaré Keats.

Deux principaux groupes de patients atteints de myélome multiple sont connus depuis un certain temps : un groupe hyperdiploïde avec des copies supplémentaires de chromosomes dans les cellules tumorales et un groupe non hyperdiploïde avec des réarrangements chromosomiques. L’approche utilisée par l’équipe actuelle de chercheurs leur a permis d’identifier différents sous-groupes au sein de ces grandes catégories.

« De nombreuses études ont examiné une méthode – elles examinent l’état du nombre de copies ou une autre méthode qui examine s’il y a des mutations – mais très peu d’entre elles intègrent réellement les deux pour vraiment comprendre comment un gène individuel fonctionne chez ce patient », a noté Keats. « Pour ce domaine, nous avons fourni une liste très solide de gènes candidats qui sont importants dans la maladie. »

Selon Keats, ces résultats pourraient changer la façon dont les médecins discutent avec leurs patients de l’élaboration d’un plan de traitement. Bien que l’on pense généralement que les patients hyperdiploïdes ont une survie globale plus favorable, les chercheurs ont découvert que le terme « hyperdiploïde » englobe cinq groupes différents de patients, dont l’un présente des résultats nettement moins bons et pourrait bénéficier d’une thérapie agressive.

L’un des prochains défis consiste à adapter les médicaments à des caractéristiques génétiques spécifiques, a déclaré Keats. « Nous avons clairement répondu à la question de savoir quels sont les différents types de médicaments, mais pas à quels médicaments ils répondent le mieux. »

TGen s’appuie sur ce travail pionnier pour proposer une médecine personnalisée aux patients atteints de myélome multiple en lançant le séquençage du génome entier de qualité clinique dans le laboratoire clinique TGen. Ce test fournira aux patients et à leur équipe soignante une image complète de la génétique de chaque tumeur ainsi que des informations pronostiques et des recommandations thérapeutiques dans un délai de 48 heures.