Pour subvertir la réponse immunitaire, le SARS-CoV-2 stimule la production de protéines sans fonction protectrice
Selon des chercheurs brésiliens, le SARS-CoV-2 utilise cette stratégie pour manipuler le mécanisme des cellules de défense de l’hôte. Cette découverte ouvre la voie au développement de nouvelles thérapies. Crédit : NIAD/NIH
Pour échapper à la réponse immunitaire de l’hôte humain, le SARS-CoV-2, le coronavirus responsable de la COVID-19, utilise le mécanisme des cellules de défense pour induire l’expression d’isoformes improductives de gènes antiviraux clés – des formes variantes de gènes qui résultent de processus d’épissage ou de transcription perturbés et ne codent pas pour des protéines fonctionnelles (protectrices).
Il s’agit d’une des principales conclusions d’une étude menée par des chercheurs de l’hôpital juif brésilien Albert Einstein (HIAE), de l’université de São Paulo (USP) et de l’université fédérale de Minas Gerais (UFMG). L’étude, qui offre une base pour le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques pour lutter contre la COVID-19, est publiée dans la revue Journal international des sciences moléculaires.
D’autres virus, dont les coronavirus, perturbent également la production de protéines en perturbant l’épissage de l’ARN messager (ARNm), mais le SARS-CoV-2 va plus loin en bloquant l’expression des interférons, une famille de protéines qui aident le système immunitaire à combattre l’infection, et en modulant des cellules immunitaires spécifiques. Le manque de détails précis concernant ce processus a constitué un obstacle majeur au développement de nouvelles options pour traiter la COVID-19.
Dans cette étude, les chercheurs ont cherché à confirmer l’hypothèse suggérée dans la littérature scientifique selon laquelle la production d’isoformes d’ARNm instables peut donner naissance à des protéines non fonctionnelles.
Pour ce faire, ils ont mené une analyse intégrative combinant plusieurs ensembles de données transcriptomiques et protéomiques pour arriver à une caractérisation détaillée du paysage cellulaire hôte infecté, à la fois in vitro et in vivo.
Ils ont découvert que l’infection par le SARS-CoV-2 induisait une expression prédominante d’isoformes d’épissage improductives dans des gènes clés liés au système immunitaire et à la réponse antivirale (gènes de signalisation IFN, ISG, gènes du CMH de classe I et gènes de la machinerie d’épissage tels que IRF7, OAS3, HLA-B et HNRNPH1). Ces gènes produisaient également moins de protéines « normales », qui étaient à leur tour plus sensibles aux attaques des protéines virales.
En revanche, les gènes de cytokines et de chimiokines inflammatoires (tels que IL6, CXCL8 et TNF) ont principalement produit des isoformes d’épissage productives en réponse à l’infection.
« Bien que plus de 50 articles sur la transcriptomique du COVID-19 aient été publiés, c’est la première fois que cette stratégie virale est démontrée au niveau moléculaire. De plus, nous n’avons utilisé que des données accessibles au public », a déclaré Glória Regina Franco, professeure titulaire de l’Institut des sciences biologiques (ICB) de l’UFMG et dernière auteure de l’article.
« En démontrant l’interaction moléculaire entre le SARS-CoV-2 et le mécanisme d’épissage de l’hôte, nous fournissons des informations fondamentales sur les cibles potentielles des médicaments antiviraux et des interventions immunomodulatrices. Nos résultats peuvent être utilisés pour orienter les thérapies qui rétablissent le traitement normal de l’ARN lors d’infections virales, par exemple », a déclaré Helder Takashi Imoto Nakaya, chercheur principal au HIAE, professeur à la School of Pharmaceutical Sciences (FCF) de l’USP et avant-dernier auteur de l’article.
COVID long et futures pandémies
Même si la pandémie de COVID-19 est terminée, de nouvelles publications sur le sujet sont toujours importantes, a déclaré Nakaya. « Les nouveaux coronavirus peuvent provoquer de graves pandémies. L’émergence du SARS-CoV-3, du SARS-CoV-4, etc., est parfaitement plausible. Plus nous en saurons sur le fonctionnement de ces virus, mieux ce sera », a-t-il ajouté.
Il est également important de mener davantage de recherches sur les dommages causés par le virus au niveau moléculaire, à la lumière des nombreux rapports sur le COVID long, un problème auquel sont confrontées des millions de personnes dans le monde et de plus en plus négligé.
Des chercheurs de l’Université de l’Indiana et de l’Université d’État du Michigan aux États-Unis ont également participé à l’étude.
Plus d’informations :
Thomaz Lüscher Dias et al, Le SARS-CoV-2 induit sélectivement l’expression d’isoformes d’épissage improductives d’interféron, de gènes du CMH de classe I et de la machinerie d’épissage, Journal international des sciences moléculaires (2024). DOI : 10.3390/ijms25115671
Citation:Pour subvertir la réponse immunitaire, le SARS-CoV-2 stimule la production de protéines sans fonction protectrice (2024, 20 août) récupéré le 20 août 2024 à partir de
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