Des microbiotes intestinaux « malsains » associés à un risque accru de décès après une transplantation d’organe

Des modèles de microbiote intestinal « malsains » sont liés à un risque accru de décès après une transplantation d’organe solide, selon une étude publiée en ligne dans la revue Intestin.

Bien que ces schémas microbiens particuliers soient associés à des décès quelle qu’en soit la cause, ils sont spécifiquement associés à des décès par cancer et infection, quel que soit l’organe (rein, foie, cœur ou poumon) transplanté, comme le montrent les résultats.

La composition du microbiote intestinal est associée à diverses maladies, notamment les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin et le diabète. Mais peu d’études disposent des données nécessaires pour analyser l’association entre le microbiote intestinal et la survie à long terme, expliquent les chercheurs.

Et bien qu’un passage d’un modèle normal de microbes à un modèle « malsain », connu sous le nom de dysbiose intestinale, ait été associé à un risque accru de décès en général, il n’est pas clair si cela pourrait également être associé à la survie globale dans des maladies spécifiques, ajoutent-ils.

Pour le savoir, ils ont étudié la relation entre la dysbiose intestinale et la mortalité, toutes causes confondues ou non, chez les receveurs de greffes d’organes solides, chez qui la prévalence de la dysbiose intestinale est bien plus élevée que dans la population générale. Cela fait d’eux un groupe idéal pour étudier les associations entre la dysbiose intestinale et la survie à long terme, affirment les chercheurs.

Ils ont analysé les profils du microbiome de 1 337 échantillons fécaux fournis par 766 receveurs de transplantation rénale, 334 de foie, 170 de poumon et 67 de cœur et les ont comparés aux profils du microbiome intestinal de 8 208 personnes vivant dans la même zone géographique du nord des Pays-Bas.

L’âge moyen des receveurs de greffe était de 57 ans, et plus de la moitié étaient des hommes (784 ; 59 %). En moyenne, ils avaient reçu leur greffe 7,5 ans auparavant.

Au cours d’une période de suivi allant jusqu’à 6,5 ans, 162 receveurs sont décédés : 88 receveurs de rein, 33 receveurs de foie, 35 receveurs de poumon et 6 receveurs de cœur. Quarante-huit (28 %) sont décédés d’une infection, 38 (23 %) d’une maladie cardiovasculaire, 38 (23 %) d’un cancer et 40 (25 %) d’autres causes.

Les chercheurs ont examiné plusieurs indicateurs de dysbiose intestinale dans ces échantillons : la diversité microbienne ; la mesure dans laquelle leur microbiome intestinal différait du microbiome moyen de la population générale ; la prévalence des gènes de résistance aux antibiotiques ; et les facteurs de virulence qui aident les bactéries à envahir les cellules et à échapper aux défenses immunitaires.

L’analyse a révélé que plus les profils du microbiome intestinal des receveurs de greffe divergeaient de ceux de la population générale, plus ils étaient susceptibles de mourir plus tôt après leur intervention, quel que soit l’organe transplanté.

Des associations similaires sont apparues pour l’abondance des gènes de résistance aux antibiotiques et des facteurs de virulence.

Les chercheurs ont identifié 23 espèces bactériennes parmi tous les receveurs de greffe qui étaient associées à un risque accru ou réduit de décès toutes causes confondues.

Par exemple, une abondance de quatre espèces de Clostridium était associée à la mort toutes causes confondues et spécifiquement à l’infection, tandis qu’une abondance de Hangatella Hathewayi et de Veillonella parvula était associée à la mort toutes causes confondues et spécifiquement à l’infection.

Un nombre élevé de Ruminococcus gnavus, mais un faible nombre de Germigger formicilis, de bactéries Firmicutes CAG 83, d’Eubacterium hallii et de Faecalibacterium prausnitzi étaient associés à la mort toutes causes confondues et spécifiquement au cancer.

Ces quatre dernières espèces produisent toutes du butyrate, un acide gras à chaîne courte qui, entre autres, est un agent anti-inflammatoire et aide à maintenir l’intégrité de la paroi intestinale.

Les chercheurs ont ensuite analysé simultanément toutes les espèces bactériennes à l’aide de l’IA. Cette analyse a révélé un deuxième schéma de 19 espèces différentes, également associées à un risque accru de décès.

Il s’agit d’une étude observationnelle et, par conséquent, aucune conclusion définitive ne peut être tirée sur les rôles causaux de bactéries particulières.

Mais, concluent les chercheurs, « nos résultats soutiennent les preuves émergentes montrant que la dysbiose intestinale est associée à la survie à long terme, indiquant que les thérapies ciblant le microbiome intestinal pourraient améliorer les résultats des patients, bien que les liens de cause à effet doivent d’abord être identifiés. »