Des chercheurs découvrent un lien entre les preuves génétiques et les résultats des essais
Regroupement hiérarchique de la similarité des raisons d’arrêt d’après les données de Pak et al. et 447 essais supplémentaires arrêtés en raison de la COVID-19. Crédit : Génétique de la nature (2024). DOI : 10.1038/s41588-024-01854-z
L’échec est le résultat le plus probable d’un essai clinique. Tirer des leçons de ces échecs en comprenant quels facteurs maximisent les chances de réussite d’un essai contribuerait à améliorer le processus de découverte de médicaments. Cependant, il est difficile d’accéder aux informations sur les essais cliniques qui ont échoué, car la littérature sur la découverte de médicaments est biaisée en faveur de la publication de résultats positifs.
Les essais cliniques interrompus avant leur date d’échéance prévue constituent une source représentative des résultats des essais. Les essais interrompus répertoriés sur ClinicalTrials.gov doivent fournir une raison de l’arrêt sous forme de texte libre. Ces informations sont librement accessibles et peuvent être exploitées pour déterminer quelles caractéristiques rendent les essais plus susceptibles d’échouer. Cela pourrait éclairer les futures initiatives de découverte de médicaments.
Dans une étude publiée dans Génétique de la natureDes chercheurs d’Open Targets et de l’Institut européen de bioinformatique de l’EMBL (EMBL-EBI) ont créé une approche d’apprentissage automatique pour analyser les raisons en texte libre expliquant pourquoi 28 842 essais cliniques ont été arrêtés.
Ils ont ensuite évalué les preuves génétiques étayant les relations entre la cible et la maladie dans ces essais. Leur analyse a révélé que les essais cliniques interrompus pour des raisons négatives, telles que des problèmes de sécurité ou d’efficacité, étaient moins étayés par des preuves génétiques. En fait, l’étude indique que les preuves génétiques réduisent de moitié les risques d’arrêt prématuré.
« Les résultats de notre analyse soulignent l’importance cruciale de l’intégration des preuves génétiques dans le développement de médicaments », a déclaré Olesya Razuvayevskaya, chercheuse postdoctorale en traitement du langage naturel chez Open Targets.
« Cela pourrait potentiellement réduire les taux élevés d’échecs des essais, ce qui conduirait à des thérapies plus efficaces et plus sûres et jetterait les bases pour réduire les risques des futures études cliniques. »
Une approche d’apprentissage automatique utilisant des données ouvertes
Le modèle créé pour ce travail est disponible pour téléchargement et exploration interactive, et des prévisions à jour pour les études cliniques plus récentes sont disponibles via la plateforme Open Targets.
L’équipe a créé un modèle de traitement du langage naturel pour classer les raisons de l’arrêt du traitement en 17 catégories. Pour chaque essai clinique, ils ont utilisé 13 sources de preuves génétiques disponibles sur la plateforme Open Targets pour évaluer la force de l’association entre la cible du médicament et l’indication de la maladie.
Dans l’ensemble, l’analyse a montré que les essais interrompus sont plus susceptibles d’échouer en raison de facteurs coïncidents précoces qui ne sont pas nécessairement liés à la force des preuves reliant la cible du médicament à la maladie. Par exemple, plus d’un tiers des essais s’arrêtent en raison d’un recrutement insuffisant. Pour les 12,7 % d’essais qui ont échoué pour des raisons de sécurité ou d’efficacité, les auteurs ont trouvé une corrélation avec un manque de preuves génétiques solides reliant la cible à la maladie.
Des informations génétiques à l’origine de l’arrêt des essais cliniques
Près de la moitié des essais interrompus étudiés par l’équipe concernaient des essais sur le cancer, et ceux-ci étaient plus susceptibles d’être interrompus pour des raisons de sécurité ou d’effets secondaires. Les auteurs ont trouvé plusieurs caractéristiques des cibles dans ces essais qui étaient corrélées à des problèmes de sécurité : contrainte génétique (une mesure de l’importance d’un gène), multiples interactions physiques connues et manque de spécificité tissulaire.
L’analyse de ces facteurs défavorables pourrait aider à prévenir une interruption prématurée pour des raisons de sécurité ou d’effets secondaires, maximisant ainsi les chances de réussite d’un essai clinique.
« Les analyses rétrospectives précédentes d’Open Targets ont révélé que les médicaments sont plus susceptibles d’être approuvés lorsque le lien entre la maladie et la cible du médicament est étayé par des preuves issues d’études génétiques et génomiques », a déclaré David Ochoa, coordinateur de la plateforme Open Targets.
« Avec cette nouvelle recherche, le support génétique est clairement à la fois prédictif de la progression des essais cliniques et protecteur contre l’arrêt prématuré des essais. Cela renforce fortement l’objectif fondateur d’Open Targets d’utiliser les informations générées par le séquençage génétique et les études génomiques pour améliorer systématiquement la sélection des cibles pour le développement de médicaments. »
Plus d’information:
Olesya Razuvayevskaya et al., Facteurs génétiques associés aux raisons de l’arrêt des essais cliniques, Génétique de la nature (2024). DOI : 10.1038/s41588-024-01854-z
Fourni par le Laboratoire européen de biologie moléculaire
Citation: Pourquoi les essais cliniques s’arrêtent : les chercheurs trouvent un lien entre les preuves génétiques et les résultats des essais (2024, 1er août) récupéré le 1er août 2024 à partir de
Ce document est soumis au droit d’auteur. En dehors de toute utilisation équitable à des fins d’étude ou de recherche privée, aucune partie ne peut être reproduite sans autorisation écrite. Le contenu est fourni à titre d’information uniquement.