Un atlas complet des cellules mammaires normales offre un nouvel outil pour comprendre l’origine du cancer du sein

Des chercheurs du Melvin and Bren Simon Comprehensive Cancer Center de l’Université d’Indiana ont réalisé la cartographie la plus complète des cellules mammaires saines à ce jour. Ces résultats offrent un outil important aux chercheurs de l’IU et d’ailleurs pour comprendre comment le cancer du sein se développe et les différences dans le tissu mammaire selon les origines génétiques.

Publié ce mois-ci dans Médecine naturelleles chercheurs ont développé un atlas complet des cellules du tissu mammaire, comprenant des détails sur la façon dont le génome est organisé dans chaque type de cellule et les effets de cette organisation du génome sur la façon dont l’ARN est produit dans chaque type de cellule pour piloter leur fonction dans diverses parties du sein, en utilisant du tissu mammaire sain provenant de femmes d’ascendances diverses.

« Le cancer du sein présente des résultats variables en fonction de l’ascendance génétique », a déclaré Harikrishna Nakshatri, Ph.D., auteur principal de l’étude. « Bien que les facteurs socio-économiques soient certainement un facteur contributif, nous pensons que la biologie et l’ascendance jouent également un rôle. Cette étude nous aidera à aborder cet aspect biologique et ancestral. »

Nakshatri est professeur Marian J. Morrison de recherche sur le cancer du sein à la faculté de médecine de l’IU et chercheur au Vera Bradley Foundation Center for Breast Cancer Research au IU Simon Comprehensive Cancer Center.

Le laboratoire de Nakshatri a séquencé 88 000 noyaux cellulaires de 92 femmes ayant fait don de tissus mammaires sains à la Komen Tissue Bank du IU Simon Comprehensive Cancer Center. Les donneurs étaient des personnes d’origine africaine, européenne, amérindienne, hispanique, est-asiatique, sud-est-asiatique et ashkénaze-juive-européenne.

La cartographie cellulaire comprend des données non seulement sur les gènes exprimés dans divers types de cellules, mais aussi sur la manière dont les gènes sont organisés et sur les expressions génétiques spécifiques limitées à chaque type de cellule. Les chercheurs savent que le cancer du sein provient le plus souvent de types de cellules spécifiques et que l’endroit où il se développe conduit à différents types de cancer et à différentes réponses au traitement. Cette étude pourrait améliorer la compréhension du développement du cancer du sein et conduire à l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques.

« Cette recherche visait à comprendre les éléments constitutifs du sein normal, c’est-à-dire le nombre de types de cellules différents présents dans le sein normal et la variabilité des éléments constitutifs des cellules en fonction de l’ascendance génétique », a déclaré Nakshatri. « Si nous ne savons pas de quels types de cellules du sein provient le cancer, nous ne pouvons pas vraiment déterminer ce qui ne va pas exactement dans le cancer du sein par rapport au sein normal. »

Les ressources de recherche disponibles jusqu’à présent utilisaient des tissus normaux issus de chirurgies du cancer du sein et des échantillons de mammoplastie de réduction. La Komen Tissue Bank, la seule banque de tissus mammaires sains au monde, offre aux chercheurs de l’IU une opportunité unique pour cette étude.

« Nous utilisons des tissus de femmes qui ne souffrent pas cliniquement du cancer du sein. C’est pourquoi nous pensons que les données que nous avons créées sont proches de la perfection, c’est-à-dire les plus proches possibles », a déclaré Nakshatri. « Les données que nous avons générées à partir de ces données resteront à perpétuité, car elles seront utilisées par de très nombreux groupes pour des recherches futures. »

Les informations de l’atlas cellulaire issues de l’étude seront largement accessibles aux chercheurs sur le cancer du sein via les bases de données proposées par les National Institutes of Health, Human Cell Atlas et Chan Zuckerberg CELL by GENE Discover.

Cette recherche est l’aboutissement de près de cinq années de travail intense du laboratoire Nakshatri et d’analyses bioinformatiques. Parmi les autres auteurs de l’IU School of Medicine et de l’IU Simon Comprehensive Cancer Center figurent Poornima Bhat-Nakshatri, Hongyu Gao, Aditi S. Khatpe, Adedeji K. Adebayo, Patrick C. McGuire, Cihat Erdogan, Duojiao Chen, Guanglong Jiang, Rana German, Lydia Emmert, George Sandusky, Anna Maria Storniolo et Yunlong Liu.