Transmission cachée du virus de la grippe aviaire H5N1 trouvé dans le bétail laitier du Texas

Des scientifiques du Centre national des maladies animales du Département de l’Agriculture des États-Unis, avec de multiples collaborateurs universitaires, étatiques et fédéraux, ont identifié l’émergence et la propagation interétatique de la grippe aviaire hautement pathogène A (H5N1) chez les bovins laitiers.

L’analyse génétique confirme qu’un événement de réassortiment chez les oiseaux sauvages a précédé une seule transmission aux bovins, après quoi des bovins asymptomatiques ou présymptomatiques ont facilité la propagation du virus aux États-Unis. Le séquençage du génome viral a révélé des mutations à basse fréquence liées à l’efficacité de la transmission et à l’adaptation des mammifères, ce qui soulève des problèmes de santé publique concernant les futurs déversements zoonotiques.

Les virus de la grippe aviaire hautement pathogènes causent des dommages critiques à la santé animale et à l’économie agricole et peuvent comporter un risque pandémique. Les virus liés à l’oie / le Guangdong 2.3.4.4 Le clade H5NX de l’hémagglutinine s’est propagé à près de 100 pays, créant un panzootique reconnu.

Après une introduction transatlantique à la fin de 2021, le clade 2.3.4.4b H5N1 a provoqué des épidémies généralisées à travers l’Amérique du Nord, conduisant à une mortalité étendue parmi les oiseaux sauvages, la volaille et les mammifères. Les événements de transmission entre espèces ont soulevé des préoccupations urgentes concernant le potentiel d’adaptation du virus. La circulation continue du clade HPAI 2.3.4.4b chez les mammifères nécessite une surveillance minutieuse pour comprendre les risques pour l’infection humaine et la transmission.

Dans l’étude, “l’émergence et la propagation interétatique de la grippe aviaire très pathogène A (H5N1) dans les bovins laitiers aux États-Unis” ScienceLes chercheurs ont mené une enquête génomique et épidémiologique pour déterminer la source, la propagation et les implications de l’épidémie chez les bovins.

Des échantillons ont été obtenus dans 26 fermes laitières dans huit États et six fermes de volaille dans trois États lors de l’épidémie initiale.

Les chercheurs ont effectué un séquençage du génome entier sur des échantillons viraux prélevés à partir de bovins et de volaille. L’analyse phylodynynamique et la modélisation phylogénétique bayésienne ont tracé la source et la propagation de l’infection.

Les enquêtes épidémiologiques ont documenté les modèles de mouvement des animaux associés à la diffusion du virus. Les évaluations évolutives à l’hôte ont caractérisé la diversité génomique parmi les isolats de bétail. Les chaînes de transmission ont été reconstruites à l’aide d’un logiciel d’analyse génomique personnalisée.

Clade H5N1 2.3.4.4b Genotype B3.13 Le virus de la grippe A a été confirmé dans des échantillons de lait avec une détection limitée dans les écouvillons nasaux.

L’analyse phylogénétique a montré que les séquences de virus isolées de bovins se sont regroupées dans un seul groupe, soutenant un seul événement sauvage de débordement d’oiseau à catégorie à la fin de 2023, avec plusieurs mois de transmission silencieuse du bétail avant une confirmation de mars 2024. Un événement de réassortiment dans les oiseaux sauvages a précédé le débordement.

Après l’introduction dans les bovins, le virus a persisté par des preuves de transmission des bovins à la volaille, des ratons laveurs, des chats et des oiseaux sauvages, y compris des grackles communs, des merles et des pigeons.

Un travailleur laitier a été infecté par un génotype légèrement distinct des bovins échantillonnés mais lié épidémiologiquement. Bien que l’infection provenait très probablement de bovins en fonction des antécédents d’exposition, la transmission d’un autre hôte non échantillonné ne peut pas être entièrement exclue.

Les enregistrements épidémiologiques et la modélisation phylodynynamique ont documenté que le mouvement des bovins laitiers au Texas asymptomatiques ou présymptomatiques a entraîné une diffusion du virus dans huit États. Les données sur le terrain suggèrent que les vaches peuvent perdre du virus pendant deux ou trois semaines.

L’analyse de séquence du génome entier a identifié des variantes génétiques à basse fréquence associées à la virulence, à l’adaptation des mammifères et à la gamme hôte élargie, indiquant que le virus circulant chez les bovins laitiers peut posséder un potentiel évolutif latent pour devenir plus transmissible ou pathogène chez les mammifères. Bien que ces variantes ne soient pas dominantes, la surveillance est critique, car leur expansion pourrait augmenter le risque zoonotique.

La transmission continue de H5N1 HPAI dans les populations de bovins laitières augmente le risque d’infection et de propagation du virus aux humains et à d’autres hôtes animaux. Des marqueurs moléculaires associés à une efficacité de transmission accrue et des changements phénotypiques ont été détectés à basse fréquence des isolats de bovins.

Les virus circulant chez les bovins représentent une menace pandémique potentielle, étant donné les preuves d’événements de transmission de bétail à humaine. La surveillance des bovins et d’autres animaux agricoles est essentielle pour l’alerte précoce et l’évaluation des risques. Les résultats soulignent la nécessité de tester le bétail avant le mouvement interétatique et une stratégie nationale de test de lait.

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