Un nouveau test de laboratoire pour détecter les souches persistantes du VIH en Afrique pourrait aider à la recherche d’un remède

Une équipe multinationale dirigée par des chercheurs de Weill Cornell Medicine a développé un test qui aidera à mesurer la persistance du VIH chez les personnes affectées par des souches virales trouvées principalement en Afrique – un outil essentiel dans la recherche d’un remède contre le VIH qui bénéficiera aux patients du monde entier.

L’étude, publiée dans Nature Communications Le 2 juillet, une étude a permis de combler une lacune majeure dans la recherche sur le virus de l’immunodéficience humaine (VIH). La plupart des études sur le VIH se sont concentrées sur les souches circulant dans les pays occidentaux, principalement chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes affectés par le sous-type B. Peu d’études ont examiné les souches circulant en Afrique, où les femmes sont touchées de manière disproportionnée.

« La recherche sur le traitement du VIH tend à se concentrer sur les souches virales circulant dans les pays développés, mais pour parvenir à un traitement applicable à l’échelle mondiale, nous devons étudier les souches virales qui affectent d’autres régions du monde », a déclaré l’auteur principal, le Dr Guinevere Lee, professeur adjoint de virologie en médecine à la Division des maladies infectieuses et professeur adjoint de microbiologie et d’immunologie à Weill Cornell Medicine.

Les résultats montrent, comme d’autres études menées dans des pays développés, que les souches du VIH circulant en Afrique créent des réservoirs viraux dans le corps humain. Bien que la thérapie antirétrovirale puisse réduire le taux de VIH dans le sang à un niveau indétectable, ces réservoirs dormants continuent de survivre.

Ils contiennent un grand nombre de génomes d’ADN proviraux défectueux qui ne peuvent pas produire de nouveaux virus infectieux, mais un petit nombre de génomes restent génétiquement intacts et prêts à produire des virus actifs si le traitement antirétroviral est interrompu.

La grande proportion de génomes viraux défectueux obscurcit les tentatives des chercheurs de quantifier avec précision les copies de provirus intacts.

« Nous cherchons une aiguille dans une botte de foin : pour parvenir à guérir le VIH, nous devons d’abord déterminer si des provirus au génome intact demeurent dans l’organisme pendant le traitement antirétroviral. Notre nouveau test nous permet de le faire. Nous devons ensuite cibler et éliminer l’ADN proviral intact capable de produire de nouveaux virus », a expliqué le Dr Lee.

Élargir la perspective de la recherche sur le VIH grâce à un nouveau test

Le Dr Lee et ses collègues ont analysé l’ADN des cellules immunitaires appelées CD4⁺ Les lymphocytes T, où se cache l’ADN viral, de 16 femmes et sept hommes recevant un traitement antirétroviral contre le VIH en Ouganda. Le séquençage génétique du virus a révélé deux sous-types prédominants du VIH-1 : A1 et D (une souche notoirement agressive). L’étude a également identifié des hybrides viraux de A1 et D.

L’équipe a ensuite modifié les tests de laboratoire existants qui identifient les provirus du sous-type B du VIH pour détecter les provirus des sous-types A1 et D. « Le nouveau test que nous avons développé aidera les chercheurs à cibler les génomes proviraux intacts pertinents pour la recherche sur le traitement du VIH pour les patients affectés par ces souches sous-étudiées », a déclaré le Dr Lee.

Le Dr Lee et ses collaborateurs multinationaux et multi-institutionnels utilisent déjà le nouveau test pour étudier la persistance virale à long terme en Ouganda. Leurs résultats montrent que la composition du paysage génomique proviral du VIH est globalement comparable entre les sous-types A1, D et B, ce qui suggère que les approches visant à cibler les réservoirs intacts du VIH en Afrique seront confrontées aux mêmes défis de type « aiguille dans une botte de foin » qu’en Amérique du Nord et en Europe.

Les études futures devront également évaluer les différences dans les sous-types non B pour comprendre si des facteurs spécifiques au sous-type ont un impact sur la persistance, la réactivation ou la clairance dans les réservoirs viraux.

Des chercheurs de l’Université Simon Fraser, au Canada, du Centre d’excellence de la Colombie-Britannique sur le VIH/SIDA, au Canada, du Programme des sciences de la santé de Rakai, en Ouganda, de l’Université du Cap, en Afrique du Sud, et de la Faculté de médecine de l’Université Johns Hopkins ont également contribué à cette étude.